रोगज़नक़ जीनोमिक्स
मेरी प्रयोगशाला जीनोमिक्स का उपयोग यह जांचने के लिए करती है कि संक्रामक रोग कैसे महामारी पैदा कर सकते हैं और तेजी से दुनिया भर में फैल सकते हैं। इसके माध्यम से, हम बेहतर नियंत्रण कार्यक्रमों का मार्गदर्शन करने की आशा करते हैं जो बीमारी के प्रसार को रोकने में अधिक प्रभावी होंगे। वर्तमान में हम तीन प्रमुख विषयों का अनुसरण कर रहे हैं जिनमें शामिल हैं (1) महामारी हैजा के संचरण की गतिशीलता और विकास, (2) माउंटेन वेस्ट में SARS-CoV-2 की जीनोमिक महामारी विज्ञान, और (3) रोगाणुरोधी प्रतिरोध को समझने के लिए एक स्वास्थ्य दृष्टिकोण को लागू करना। .
प्रकोप की विस्फोटक प्रकृति और विशिष्ट चावल-पानी के मल के कारण अतिसार रोगों की महामारी विज्ञान के कई पहलुओं को समझने के लिए हैजा एक महान मॉडल के रूप में कार्य करता है। संचरण की हमारी अधिक वैश्विक रूप से केंद्रित जांच के आधार पर, हमारा ध्यान इस ओर बढ़ रहा है कि हम इस जीनोमिक जानकारी का उपयोग सार्वजनिक स्वास्थ्य हस्तक्षेपों, जैसे कि घरों या जिलों के लिए प्रासंगिक स्थानिक पैमानों पर कैसे कर सकते हैं। हम R . जैसे प्रमुख महामारी विज्ञान मापदंडों के स्वतंत्र अनुमान प्रदान करने के लिए वास्तविक समय अनुक्रमण की उपयोगिता में भी रुचि रखते हैं0 और कुल मामलों की संख्या का अनुमान। इन उपकरणों के साथ हम बेहतर भविष्यवाणियां प्रदान कर सकते हैं कि अगले हैजा का प्रकोप कहां हो सकता है और हम पीड़ित क्षेत्रों में हैजा को रोकने के लिए तर्कसंगत, साक्ष्य-आधारित हस्तक्षेप तैयार कर सकते हैं।
2020 के मार्च से शुरू होकर, मेरी प्रयोगशाला ने तेजी से SARS-CoV-2 के जीनोम के अनुक्रमण पर काम करने के लिए अनुकूलित किया, जो वर्तमान COVID-19 महामारी के लिए जिम्मेदार वायरस है। डैरेल डिनविडी की प्रयोगशाला (यूएनएम) के साथ, हम न्यू मैक्सिको और व्योमिंग के लिए अनुक्रमण और जीनोमिक्स लीड हैं और सीडीसी-स्फर्स कंसोर्टियम का हिस्सा हैं। हम NM और WY स्वास्थ्य विभाग, लॉस एलामोस नेशनल लेबोरेटरी के साथ-साथ क्षेत्रीय परीक्षण सुविधाओं के साथ मिलकर काम करते हैं ताकि नमूने प्राप्त किए जा सकें और माउंटेन वेस्ट क्षेत्र में वायरस के प्रकोप विश्लेषण और संचरण इतिहास के लिए प्रासंगिक विश्लेषण प्रदान किया जा सके। इस क्षमता में, हमने पूरे क्षेत्र के राज्यों से लगभग 1,000 वायरल जीनोम का अनुक्रम किया है। हमारा लक्ष्य अपने सार्वजनिक स्वास्थ्य अधिकारियों को इस बारे में कार्रवाई योग्य डेटा प्रदान करना है कि SARS-CoV-2 समुदायों और राज्यों के बीच कैसे फैल रहा है।
इन जीनोमिक महामारी विज्ञान तकनीकों को लागू करने में हमारी भी गहरी रुचि है, यह समझने के लिए कि कैसे रोगाणुरोधी प्रतिरोध जीन बैक्टीरिया की आबादी और इस प्रसार को चलाने वाले दबावों के माध्यम से आगे बढ़ रहे हैं। पशु और मानव चिकित्सा दोनों में रोगाणुरोधी दवाओं का अनुचित उपयोग प्रमुख जीवाणु रोगजनकों, जैसे साल्मोनेला एसपी में बढ़ते प्रतिरोध में योगदान देता है। और एस्चेरिचिया कोलाई। चूंकि मनुष्यों का स्वास्थ्य पर्यावरण और पशु स्वास्थ्य (यानी वन हेल्थ) के स्वास्थ्य पर निर्भर है, यह समझना कि एएमआर जीन और प्रतिरोधी रोगजनक पशु-मानव-पर्यावरणीय आबादी के बीच कैसे आगे बढ़ रहे हैं, सर्वोपरि है
सार्वजनिक स्वास्थ्य आपातकालीन प्रतिक्रिया, महामारी विज्ञान और निगरानी के लिए SARS-CoV-2 अनुक्रमण